感染人類的披衣菌常見的有三個種，分別是砂眼披衣菌、肺炎披衣菌、和鸚鵡披衣菌。其中後二者會引起肺炎，而砂眼披衣菌則引起性交傳染病。
砂眼披衣菌感染是最常見的性交傳染病，砂眼披衣菌是專性寄生人類細胞的細菌，由於其體積很小，比其他細菌和人類細胞小很多，剛開始發現時甚至被誤認是濾過性病毒，砂眼披衣菌血清型抗原目前已知有十八種血清型，分別命名為A,B, Ba,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L1,L2,L3. 其中B,D,E,F,G,H,I,J,K型主要感染生殖泌尿系統，造成性交傳染病，包括 -- 巴氏腺炎、子宮頸炎、子宮內膜炎、輸卵管炎、卵巢炎、骨盆腔炎、尿道炎等。
大部份的砂眼披衣菌感染後症狀為發燒、寒顫、急性腹痛、全身虛弱等，至於由L1,L2,L3三型所引起的花柳性淋巴肉芽腫，通常病菌從陰部黏膜入侵人體後，會延血液循環或淋巴循環往上蔓延，直至定居在腹股溝淋巴結或直腸淋巴結，造成淋巴結腫大、疼痛、化膿等情形。
凡有過性行為的人「披衣菌」流行率高達45%，很多人只知道淋病、梅毒這幾種惡名昭彰的性病，卻不知道性病之冠是「披衣菌」。
披衣菌感染的患者在男性常見是尿道炎， 在女性常見是子宮頸炎,潛伏期約1~3週，不過有超過一半以上的患者常常是無症狀的， 所以很難得知是什麼時候感染的，披衣菌如果沒有投與藥物，通常無法自癒，性伴侶雙方若有一人染病 ，建議兩人都要定期接受性傳染病的篩檢，因為即使是無症狀披衣菌的感染，仍然有很高的機會造成未來不孕的機率上升。
10-20% 披衣菌患者在治療後3-6個月仍有披衣菌感染或是再次感染, 所以性生活一定要注意,請注意安全性行為, 日常生活要多喝水，生活作息要正常。
披衣菌感染特性
1. 可傳染期不知，經常會復發。
2. 有很強烈且普遍的感染性，治癒後仍會再得，不具免疫性。
台北民生醫事檢驗所
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披衣菌可以潛伏很久（半年甚至一年披衣菌ptt）而且很多人是披衣菌味道，就算有戴套也可能會感染，但還好披衣菌分泌物顏色，吞2顆藥就好了。冷靜點，男友可能無辜。 07/17 感覺披衣菌dcard有點詭異 除非男友常看女性性板 07/17肺炎披衣菌本身對於這方面有研究過
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